Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Smarca4Q3TKT4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Smarca4Q3TKT4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Smarca4Q3TKT4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Smarca4Q3TKT4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Smarca4Q3TKT4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.2 ms