Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Perm1Q149B8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Perm1Q149B8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Perm1Q149B8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Perm1Q149B8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Perm1Q149B8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Perm1Q149B8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Perm1Q149B8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Perm1Q149B8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Perm1Q149B8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Perm1Q149B8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Perm1Q149B8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms