Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spata18Q0P557 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spata18Q0P557 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spata18Q0P557 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms