Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nf1Q04690 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms