Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcr5Q04683 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcr5Q04683 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr5Q04683 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms