Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kcnd1Q03719 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcnd1Q03719 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms