Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk7Q03147 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk7Q03147 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk7Q03147 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.9 ms