Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
EgfrQ01279 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms