Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DccP70211 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DccP70211 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DccP70211 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DccP70211 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DccP70211 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DccP70211 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DccP70211 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DccP70211 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DccP70211 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DccP70211 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DccP70211 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DccP70211 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DccP70211 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DccP70211 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DccP70211 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DccP70211 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DccP70211 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DccP70211 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DccP70211 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DccP70211 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DccP70211 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DccP70211 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DccP70211 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DccP70211 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DccP70211 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DccP70211 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DccP70211 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DccP70211 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DccP70211 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DccP70211 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DccP70211 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DccP70211 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DccP70211 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DccP70211 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DccP70211 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DccP70211 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DccP70211 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DccP70211 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DccP70211 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DccP70211 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DccP70211 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DccP70211 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DccP70211 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
DccP70211 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DccP70211 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DccP70211 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DccP70211 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
DccP70211 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DccP70211 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DccP70211 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DccP70211 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DccP70211 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DccP70211 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DccP70211 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DccP70211 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DccP70211 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DccP70211 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DccP70211 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DccP70211 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DccP70211 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DccP70211 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DccP70211 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DccP70211 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DccP70211 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DccP70211 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DccP70211 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DccP70211 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DccP70211 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DccP70211 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DccP70211 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DccP70211 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DccP70211 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DccP70211 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DccP70211 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DccP70211 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DccP70211 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DccP70211 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DccP70211 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DccP70211 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DccP70211 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DccP70211 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DccP70211 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DccP70211 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DccP70211 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DccP70211 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DccP70211 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DccP70211 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DccP70211 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DccP70211 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DccP70211 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DccP70211 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DccP70211 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DccP70211 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DccP70211 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DccP70211 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DccP70211 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DccP70211 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DccP70211 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DccP70211 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms