Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufm1P61961 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms