Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rad23bP54728 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rad23bP54728 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms