Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cacnb3P54285 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacnb3P54285 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms