Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RabggtbP53612 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms