Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VdrP48281 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VdrP48281 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VdrP48281 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VdrP48281 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VdrP48281 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VdrP48281 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VdrP48281 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VdrP48281 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VdrP48281 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VdrP48281 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VdrP48281 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VdrP48281 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VdrP48281 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VdrP48281 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VdrP48281 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VdrP48281 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VdrP48281 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VdrP48281 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VdrP48281 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VdrP48281 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VdrP48281 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VdrP48281 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VdrP48281 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VdrP48281 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VdrP48281 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VdrP48281 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VdrP48281 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VdrP48281 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VdrP48281 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VdrP48281 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VdrP48281 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VdrP48281 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VdrP48281 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VdrP48281 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VdrP48281 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VdrP48281 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VdrP48281 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VdrP48281 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VdrP48281 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VdrP48281 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VdrP48281 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VdrP48281 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VdrP48281 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VdrP48281 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VdrP48281 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VdrP48281 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VdrP48281 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VdrP48281 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VdrP48281 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VdrP48281 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VdrP48281 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VdrP48281 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VdrP48281 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VdrP48281 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VdrP48281 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VdrP48281 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VdrP48281 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VdrP48281 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VdrP48281 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VdrP48281 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VdrP48281 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VdrP48281 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VdrP48281 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VdrP48281 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VdrP48281 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VdrP48281 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VdrP48281 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VdrP48281 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VdrP48281 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VdrP48281 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VdrP48281 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VdrP48281 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms