Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PtprkP35822 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprkP35822 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprkP35822 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprkP35822 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PtprkP35822 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprkP35822 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtprkP35822 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtprkP35822 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprkP35822 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprkP35822 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprkP35822 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PtprkP35822 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PtprkP35822 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PtprkP35822 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PtprkP35822 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PtprkP35822 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms