Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sstr1P30873 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sstr1P30873 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sstr1P30873 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sstr1P30873 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sstr1P30873 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sstr1P30873 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sstr1P30873 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sstr1P30873 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sstr1P30873 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sstr1P30873 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sstr1P30873 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sstr1P30873 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sstr1P30873 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sstr1P30873 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sstr1P30873 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sstr1P30873 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sstr1P30873 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sstr1P30873 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sstr1P30873 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sstr1P30873 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sstr1P30873 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sstr1P30873 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sstr1P30873 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sstr1P30873 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sstr1P30873 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sstr1P30873 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sstr1P30873 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sstr1P30873 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sstr1P30873 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sstr1P30873 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sstr1P30873 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sstr1P30873 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sstr1P30873 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sstr1P30873 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sstr1P30873 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms