Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P20040 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P20040 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P20040 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P20040 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P20040 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P20040 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P20040 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P20040 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P20040 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P20040 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P20040 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P20040 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P20040 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P20040 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P20040 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P20040 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P20040 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P20040 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P20040 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
P20040 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P20040 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P20040 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P20040 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P20040 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P20040 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P20040 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P20040 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P20040 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P20040 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P20040 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P20040 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P20040 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P20040 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P20040 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P20040 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P20040 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P20040 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P20040 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P20040 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P20040 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P20040 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P20040 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P20040 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P20040 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P20040 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P20040 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P20040 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P20040 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P20040 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P20040 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P20040 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P20040 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P20040 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P20040 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P20040 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P20040 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P20040 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P20040 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P20040 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P20040 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P20040 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P20040 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P20040 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P20040 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P20040 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P20040 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P20040 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P20040 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P20040 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P20040 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P20040 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P20040 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P20040 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P20040 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P20040 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P20040 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P20040 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P20040 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P20040 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P20040 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P20040 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P20040 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P20040 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P20040 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P20040 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P20040 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P20040 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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