Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcl9P18340 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cxcl9P18340 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cxcl9P18340 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxcl9P18340 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms