Protein–RNA interactions for Protein: P09041

Pgk2, Phosphoglycerate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgk2P09041 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgk2P09041 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgk2P09041 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgk2P09041 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgk2P09041 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pgk2P09041 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgk2P09041 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms