Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gap43P06837 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gap43P06837 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gap43P06837 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gap43P06837 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gap43P06837 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gap43P06837 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gap43P06837 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gap43P06837 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gap43P06837 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gap43P06837 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gap43P06837 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 734.8 ms