Protein–RNA interactions for Protein: P06328

Ig heavy chain V region VH558 B4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06328 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06328 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06328 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06328 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06328 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06328 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06328 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P06328 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06328 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P06328 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06328 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06328 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06328 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06328 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06328 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06328 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06328 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06328 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06328 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06328 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06328 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06328 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06328 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06328 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06328 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06328 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P06328 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06328 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06328 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P06328 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P06328 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06328 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06328 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06328 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms