Protein–RNA interactions for Protein: P04756

Chrna1, Acetylcholine receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna1P04756 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna1P04756 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna1P04756 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms