Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtogO55225 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtogO55225 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtogO55225 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
OtogO55225 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtogO55225 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtogO55225 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtogO55225 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtogO55225 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtogO55225 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtogO55225 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtogO55225 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OtogO55225 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtogO55225 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtogO55225 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtogO55225 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OtogO55225 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtogO55225 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtogO55225 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtogO55225 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtogO55225 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtogO55225 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtogO55225 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtogO55225 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtogO55225 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtogO55225 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtogO55225 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtogO55225 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtogO55225 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtogO55225 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtogO55225 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtogO55225 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtogO55225 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OtogO55225 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OtogO55225 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OtogO55225 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OtogO55225 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OtogO55225 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OtogO55225 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OtogO55225 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OtogO55225 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OtogO55225 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OtogO55225 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OtogO55225 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtogO55225 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtogO55225 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtogO55225 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
OtogO55225 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
OtogO55225 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtogO55225 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtogO55225 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtogO55225 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtogO55225 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtogO55225 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtogO55225 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtogO55225 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtogO55225 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtogO55225 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtogO55225 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OtogO55225 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OtogO55225 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms