Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NmiO35309 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NmiO35309 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NmiO35309 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NmiO35309 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NmiO35309 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NmiO35309 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NmiO35309 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NmiO35309 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NmiO35309 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NmiO35309 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NmiO35309 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NmiO35309 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NmiO35309 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NmiO35309 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NmiO35309 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NmiO35309 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NmiO35309 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NmiO35309 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NmiO35309 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NmiO35309 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NmiO35309 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NmiO35309 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NmiO35309 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NmiO35309 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NmiO35309 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NmiO35309 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NmiO35309 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NmiO35309 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NmiO35309 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NmiO35309 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NmiO35309 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NmiO35309 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NmiO35309 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NmiO35309 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NmiO35309 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NmiO35309 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NmiO35309 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NmiO35309 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NmiO35309 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NmiO35309 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NmiO35309 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NmiO35309 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NmiO35309 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NmiO35309 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NmiO35309 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NmiO35309 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NmiO35309 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NmiO35309 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NmiO35309 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NmiO35309 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NmiO35309 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NmiO35309 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NmiO35309 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NmiO35309 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NmiO35309 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NmiO35309 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NmiO35309 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NmiO35309 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NmiO35309 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NmiO35309 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NmiO35309 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NmiO35309 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NmiO35309 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NmiO35309 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NmiO35309 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NmiO35309 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NmiO35309 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NmiO35309 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NmiO35309 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmiO35309 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmiO35309 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmiO35309 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmiO35309 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmiO35309 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmiO35309 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmiO35309 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NmiO35309 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NmiO35309 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NmiO35309 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NmiO35309 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NmiO35309 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NmiO35309 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NmiO35309 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NmiO35309 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NmiO35309 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NmiO35309 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NmiO35309 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NmiO35309 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NmiO35309 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NmiO35309 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NmiO35309 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NmiO35309 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NmiO35309 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NmiO35309 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NmiO35309 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NmiO35309 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NmiO35309 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NmiO35309 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NmiO35309 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms