Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3tc1G3X9F6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh3tc1G3X9F6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3tc1G3X9F6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms