Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nccrp1G3X9C2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nccrp1G3X9C2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nccrp1G3X9C2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.8 ms