Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd5G3UW60 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd5G3UW60 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms