Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M1F7CXU4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M1F7CXU4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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