Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Igkv1-99F6XWB2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms