Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pagr1bF6V0H0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pagr1bF6V0H0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms