Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
BC005561E9Q5E2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BC005561E9Q5E2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
BC005561E9Q5E2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BC005561E9Q5E2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145 ms