Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pdzd2E9Q1M1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdzd2E9Q1M1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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