Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2012B1B0R1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2012B1B0R1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2012B1B0R1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2012B1B0R1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2012B1B0R1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms