Protein–RNA interactions for Protein: B1AUR6

Mms22l, Protein MMS22-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms22lB1AUR6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mms22lB1AUR6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mms22lB1AUR6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mms22lB1AUR6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms