Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M5A7VMS3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M5A7VMS3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M5A7VMS3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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