Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms