Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b5A3FIN4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp8b5A3FIN4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp8b5A3FIN4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms