Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVP8

Gm5580, Predicted pseudogene 5580, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5580A0A0N4SVP8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5580A0A0N4SVP8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5580A0A0N4SVP8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5580A0A0N4SVP8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm5580A0A0N4SVP8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5580A0A0N4SVP8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5580A0A0N4SVP8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5580A0A0N4SVP8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5580A0A0N4SVP8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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