Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms