Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms