Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S6

Cldn10, Claudin-10, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn10Q9Z0S6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn10Q9Z0S6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn10Q9Z0S6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms