Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms