Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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CubnQ9JLB4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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CubnQ9JLB4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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CubnQ9JLB4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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CubnQ9JLB4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CubnQ9JLB4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms