Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms