Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms