Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms