Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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