Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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