Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhox9Q9EQM5 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms