Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tmem43Q9DBS1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem43Q9DBS1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms